Sérgio Nunes é natural do Porto e Professor na Universidade do Porto desde 2001.

Atualmente, é Professor Associado do Departamento de Engenharia Informática da Faculdade de Engenharia, onde leciona nas áreas das tecnologias web, bases de dados, e recuperação de informação. É investigador do INESC TEC desde 2010, desenvolvendo trabalho nos domínios dos sistemas de informação, processamento de linguagem natural, e em diversos problemas relacionados com acesso a informação.

Entre 2014 e 2018, foi Diretor do Centro de Competências para os Media da Universidade do Porto (MIL), tendo coordenado a instalação desta estrutura e a mobilização de equipas multidisciplinares que integraram elementos das diversas unidades orgânicas da universidade. Integra atualmente a Comissão Executiva do Departamento de Engenharia Informática.